يولى البرنامج القومى لمناهضة ختان الإناث، اهتمامًا كبيرًا بدعم البرامج التوعية التى تهدف للقضاء على جرائم ختان البنات فى مصر، والوصول لحد اختفائها من المجتمع المصرى.